يعتبر القسم التجاري مسؤولًا عن إدارة الاتفاقيات بما في ذلك مفاوضات العقود. وتلتزم جميع الاتفاقيات بآخر تحديثات اتفاقية المناولة الأرضية القياسية SGHA الصادرة عن الاتحاد الدولي للنقل الجوي. ويعمل القسم على تحديد متطلبات العملاء والعمل عن كثب معهم لضمان التشغيل المرن في البحرين. ويتم الحفاظ على قنوات الاتصال المفتوحة بين العملاء والإدارة التجارية وجميع الإدارات التشغيلية ذات الصلة في شركة خدمات مطار البحرين. كما يدير القسم الرسوم والأسعار لجميع الخدمات التي تقدمها الشركة إلى جانب تقديم خدمات جديدة بالتعاون مع الإدارات الأخرى.  تُقاس الرسوم والأسعار بشكل مستمر مقابل الصناعة لضمان القدرة التنافسية واكتساب فهم أفضل لكيفية خدمة عملائنا بشكل أفضل. ويتم التعامل مع تحديد العطاءات العائمة وتقديمها من قبل الإدارة من خلال تجميع جميع الوثائق والمقترحات اللازمة لمثل هذه الفرص. يوجد لدينا في الوقت الحالي 30 شركة طيران و 4 عملاء للتموين وأكثر من 15 وكالة تابعة لجهات خارجية على متن الطائرة كعملاء.